
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN"

    "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">

<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">

    <head>

        <title></title>

    </head>

    <body>

        <p>

            Good day<br />

            <br />

            I like the mapping sequence conservation tool in chimera, however I ran into a problem that IĀ could not overcome with anything IĀ found online.<br />

            <br />

            I have the consensus mapped onto my protein but that is not what IĀ want. IĀ want to show how the residues of my protein are conserved. For example at a particular residue the consensus is a C but in my structure its a W. at the moment the W is colored to be highly conserved based on the consenus of the C. The W is maybe 15% conserved, how can IĀ map the conservation of my sequence compared to all the other sequences.<br />

            <br />

            IĀ hope IĀ explained what my issue is<br />

            Thank you for this great tool<br />

            Matthias Fellner<br />

        </p>

    </body>

</html>