<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii" class="">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; font-size: 14px; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">

<div class="">Hi,</div>

<div class="">Do you know if there is a method to calculate dipoles in Chimera?  I have generated a PQR structure in predicted protonation state and uploaded it onto Chimera.  I then used a downloaded app called dimer.py to calculate the dipole moments of two of the

 same monomers rotated 90degrees.  Technically they should both give the same dipole as the structures align 100% but according to the PDB coordinates are only rotated relative to one another.  The dipole.py scipt is calculating them as two different dipoles.

  Can you help me with this?</div>

<div class="">Thanks,</div>

<div class="">Vatsala Sagar</div>

</div>

</body></html>