<div dir="ltr">Thanks Elaine,<div><br></div><div>I was able to get the effect by saving a separate image of just the ligand alone and a transparent background. I used different lighting/texture settings for the ligand only image. Then in photoshop I manually superimposed the brighter and shinier ligand on top of my original image. It worked out well, but requires a few steps to see what you get.</div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="m_37933297781490680gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div><font face="arial, helvetica, sans-serif">Oliver</font></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Tue, Dec 6, 2016 at 9:01 PM, Elaine Meng <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu" target="_blank">meng@cgl.ucsf.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">Hi Oliver,<div>Sorry, the lighting and shininess settings are global and always apply to all models.  In the Lighting dialog (in menu under Tools… Viewing Controls), you can drag the lights around to interactively adjust their directions, but at least in my experience trying to spotlight some area doesn’t help much because other things in the vicinity will be just as shiny.</div><div><br></div><div>It depends on what you’re showing, but you might try making everything except the ligand transparent.  E.g. something like</div><div><br></div><div>open 2gbp</div><div>show ligand</div><div>rep sphere ligand</div><div>trans 65 ~ ligand</div><div><br></div><div>… or if you wanted white background, then</div><div><br></div><div>back solid white</div><div><br></div><div>I hope this helps,</div><div>Elaine<br><div>----------<br>Elaine C. Meng, Ph.D. <br>UCSF Computer Graphics Lab (Ch<wbr>imera team) and Babbitt Lab<br>Department of Pharmaceutical C<wbr>hemistry<br>University of California, San <wbr>Francisco<br><br><img height="256" width="391" id="m_37933297781490680m_3187191577305146123D72C62C6-3530-4558-8E82-45E9DF3BAF91" src="cid:1D80D9D7-7581-4267-BBA3-8F30F095754D@compbio.ucsf.edu"></div><div><div class="m_37933297781490680h5"><br><blockquote type="cite">On Dec 6, 2016, at 6:31 AM, Oliver Grant &lt;<a href="mailto:olivercgrant@gmail.com" target="_blank">olivercgrant@gmail.com</a>&gt; wrote:<br><br>Hi all,<br>Is it possible to use the lighting command and have it apply only to particular models? I&#39;d like my ligand to &quot;pop&quot; out by having a light that only shines on it, and not the protein.<br>Oliver<br></blockquote><br></div></div></div></div></blockquote></div><br></div></div>