<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8" /></head><body style='font-size: 10pt; font-family: Verdana,Geneva,sans-serif'>
<p>&nbsp;</p>
<p>Hi,</p>
<p>Thank you very much for fast and comprehensive reply.&nbsp;</p>
<p>Regards,</p>
<div>---<br />
<div class="pre" style="margin: 0; padding: 0; font-family: monospace">Bahareh Behkamal<br /> Ph. D. Candidate of Computer Engineering<br /> Researcher in Structural Bioinformatics <br /> Dept. of Computer Engineering<br /> Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran</div>
</div>
<p>&nbsp;</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>On 2016-10-25 03:48, Eric Pettersen wrote:</p>
<blockquote type="cite" style="padding: 0 0.4em; border-left: #1010ff 2px solid; margin: 0"><!-- html ignored --><!-- head ignored --><!-- meta ignored -->Hi Bahareh,
<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space: pre;"> </span>This file you sent is one of the files that compose a Chimera extension named SSE Tracer. &nbsp;The file you sent indicates that there must be at least one additional file (named gui.py) and there may be others. &nbsp;So, the ChimeraExtension.py file and the gui.py and whatever other files should all be together in one folder, let's call it "sse-tracer" for example purposes. &nbsp;You would get Chimera to load the extension by choosing Chimera's Favorites-&gt;Add to Favorites/Toolbar... menu entry. &nbsp;At the bottom of the resulting dialog is a "Locations" box that is probably empty in your case. &nbsp;Use the "Add..." button below the box and in the resulting dialog choose the folder <em class="">containing</em>&nbsp;the sse-tracer folder (not the sse-tracer folder itself!) &mdash; i.e. the <em class="">parent</em> folder for sse-tracer. &nbsp;Click OK on the file dialog and the SSE Tracer extension should appear in Chimera's Tools-&gt;Utilities menu. &nbsp;You probably also want to click "Save" on the Tools preferences dialog you were using so that Chimera will remember where to look for the SSE Tracer extension the next time you use Chimera.</div>
<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space: pre;"> </span>Now, I have no idea how the SSE Tracer extension itself works &mdash; I didn't know it existed until you sent your mail. &nbsp;Hopefully, there was some documentation for it that came along with your download.</div>
<div class="">&nbsp;</div>
<div class="">&mdash;Eric</div>
<div class="">
<div class=""><br class="" />
<div class="">
<div class="" style="color: #000000; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space: pre;"> </span>Eric Pettersen</div>
<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space: pre;"> </span>UCSF Computer Graphics Lab</div>
<div class="">&nbsp;</div>
</div>
</div>
<br class="" />
<div>
<blockquote class="">
<div class="">On Oct 24, 2016, at 12:20 PM, <a class="" href="mailto:b.behkamal@stu-mail.um.ac.ir">b.behkamal@stu-mail.um.ac.ir</a> wrote:</div>
<div class="">
<div class="" style="font-size: 10pt; font-family: Verdana,Geneva,sans-serif;">
<div class="">&nbsp;</div>
<div class="">Hello,</div>
<div class="">I need to work with the extension files which is attached. The attached files is related to SSETracer. I didn't know how I can use them in chimera. Would you mind please help me about this matter and say to me the details of work step by step.</div>
<div class="">Thank you very much in advanced.</div>
<div class="">Regards,&nbsp;</div>
<div class="">-- <br class="" />
<div class="pre" style="margin: 0; padding: 0; font-family: monospace;">Bahareh Behkamal<br class="" /> Ph. D. Candidate of Computer Engineering<br class="" /> Researcher in Structural Bioinformatics <br class="" /> Dept. of Computer Engineering<br class="" /> Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran</div>
</div>
<div class="">&nbsp;</div>
</div>
<span id="cid:B77D65DF-9EB5-4E86-864B-66F051470A3F@cgl.ucsf.edu">&lt;ChimeraExtension.py&gt;</span><span id="cid:F9B262E5-6D90-4574-9653-9FB05F0FA1E5@cgl.ucsf.edu">&lt;ChimeraExtension.pyc&gt;</span>_______________________________________________<br class="" />Chimera-users mailing list: <a class="" href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br class="" />Manage subscription: <a class="" href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a></div>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</body></html>