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<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">

<div><font face="Times New Roman">Hi all,</font></div>

<div><font face="Times New Roman">I have some pdb files of ligand binding protein structures, and when I check these structures with the ribbon diagram (Presets -> Interactive 1 (ribbons)) with chimera, it not only show the "ribbon" but also the sidechain of

 some residues. I would like to know why, so I search on the Net. And I just find the site below:</font></div>

<div><font face="Times New Roman">https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/ribbonstyle/ribbonstyle.html</font></div>

<div><font face="Times New Roman">It says "By default, when ribbon is shown for a residue,</font><font color="#000000" face="Times New Roman"> the

</font><a href="https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/ribbonstyle/ribbonstyle.html#class"><font color="#000000" face="Times New Roman">mainchain atoms</font></a><font color="#000000" face="Times New Roman"> of

</font><font face="Times New Roman">that residue are hidden, except where bonded to other displayed atoms (such as the sidechain)."</font></div>

<div><font face="Times New Roman">I can't get more imformation, and still don't understand.</font></div>

<div><font face="Times New Roman">What is the rule chimera follow to show the sidechain of certain residues?</font></div>

<div><font face="Times New Roman"><br>

</font></div>

<div><font face="Times New Roman"><br>

</font></div>

<div><font face="Times New Roman">Thanks,</font></div>

<div><font face="Times New Roman">Root</font></div>

<div><br>

</div>

</div>

</body>

</html>