<div dir="ltr">To whom it may concern,<div><br></div><div>Hi, I was trying to dock a ligand into my receptor and all of the other ligands so far have worked and outputted a value, but this one compound never outputs a .pdbqt file. The other files such as the .conf and .pdb files have been created, the bottom of the screen no longer says &quot;execution in progress&quot;, and the green box remains. I&#39;ve looked at the tutorial for AutodockVina online and tried fidgeting around with it, but I seem to be extremely lost. I was wondering if you had any pointers, tips, or anything at all that could help me.</div><div><br></div><div>All the best,</div><div>Jonathan Wang</div><div><br></div></div>