<div dir="ltr"><div><div><div>Hi Kyle,<br><br></div>Using "Values at Atom Positions" (<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/density/density.html">http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/density/density.html</a>) will create an atom attribute corresponding to the density value at each atom position. Then you should be able to use "Select by attribute" to select all atoms above/below the desired threshold.<br><br></div>Cheers,<br></div>Oli.<br><div><div><div><br><br><blockquote style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex" class="gmail_quote"><pre>Dear Chimera-dev and users,

Does anyone now of a way to select only the atoms of a PDB that fall inside the displayed density of a volume?

Thanks in advance!

Best wishes,
Kyle</pre></blockquote><br></div></div></div></div>