<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=utf-8"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">Hi Luca,<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>Three things:</div><div class=""><br class=""></div><div class="">1) You should probably open sessions with File-&gt;Restore Session rather than File-&gt;Open</div><div class="">2) You shouldn’t be being asked to identify the file type, since the file name has a known suffix type (.py: &nbsp;Python). &nbsp;Make sure that the “File type” selector near the bottom left of the File-&gt;Open dialog is set to “all (guess type)” rather than “all (ask type)”</div><div class="">3) Even if you are asked the type, you should pick “Python” for .py files. &nbsp;It looks like you picked “Chimera commands”, which interprets the file as Chimera commands rather than as Python code.</div><div class=""><br class=""></div><div class="">—Eric</div><div class=""><br class=""><div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space: pre;">        </span>Eric Pettersen</div><div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space: pre;">        </span>UCSF Computer Graphics Lab</div><div class=""><br class=""></div></div>

</div>
<br class=""><div><blockquote type="cite" class=""><div class="">On Jun 30, 2016, at 1:26 AM, Luca Pellegrini &lt;<a href="mailto:lp212@cam.ac.uk" class="">lp212@cam.ac.uk</a>&gt; wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class=""><div class="">Hi,<br class=""><br class="">When I try to open a chimera session file, Chimera asks me to identify the file type, and then stops with the error message below. Can you please advice? I am using MacOSX 10.11.3.<br class=""><br class="">Best regards,<br class="">Luca<br class=""><br class="">***<br class="">You are now running Chimera version 1.11 (build 41141).<br class="">Your previous version was 1.10.1 (build 40415).<br class="">Check the release notes for new features and other info.<br class="">(To access the release notes, use the Help menu to bring up the User's Guide.<br class="">Then click the 'Documentation index' link and you will then see a link<br class="">for the release notes.)<br class="">Registration file "/Users/lp212/.chimera/registration" has expired.<br class=""><br class="">Error while sourcing SsoCdc45.py, line 0:<br class=""><br class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>"import cPickle, base64"<br class=""><br class="">Unrecognized command: "import"<br class="">Error while sourcing SsoCdc45.py, line 0:<br class=""><br class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>"import cPickle, base64"<br class=""><br class="">Unrecognized command: "import"<br class="">Error while sourcing SsoCdc45.py, line 0:<br class=""><br class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>"import cPickle, base64"<br class=""><br class="">Unrecognized command: "import"<br class="">Model 0 (Cdc45_depo.pdb) appears to be a protein without secondary structure assignments.<br class="">Automatically computing assignments using 'ksdssp' and parameter values:<br class=""> &nbsp;energy cutoff -0.5<br class=""> &nbsp;minimum helix length 4<br class=""> &nbsp;minimum strand length 3<br class="">Use command 'help ksdssp' for more information.<br class=""><br class=""><br class=""><br class="">Luca Pellegrini, PhD<br class="">Department of Biochemistry<br class="">University of Cambridge<br class="">80 Tennis Court Road<br class="">Cambridge CB2 1GA<br class="">UK<br class=""><br class="">Email: <a href="mailto:lp212@cam.ac.uk" class="">lp212@cam.ac.uk</a><br class="">Phone: 0044-1223-760469<br class=""><br class=""><br class=""><br class=""><br class=""><br class=""><br class=""><br class=""><br class=""><br class=""><br class=""><br class=""><br class="">_______________________________________________<br class="">Chimera-users mailing list: <a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu" class="">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br class="">Manage subscription: <a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" class="">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a><br class=""></div></div></blockquote></div><br class=""></div></body></html>