<div dir="ltr">Hi Elaine,<div><br></div><div>thank you for the advice..</div><div><br></div><div>its works now.</div><div><br></div><div>cheers</div><div>Ti</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jun 22, 2016 at 9:21 PM, Elaine Meng <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu" target="_blank">meng@cgl.ucsf.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span class="">On Jun 22, 2016, at 1:14 PM, T-I &lt;<a href="mailto:ignatiou@gmail.com">ignatiou@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
<br>
&gt; Dear Elaine,<br>
&gt; I&#39;m a student from London and I have a quick question for you.<br>
&gt;<br>
&gt; I have a single pdb file consisting of 7 separate subunit chains (with TER between each chain).<br>
&gt;<br>
&gt; I would like to know how to assign an identifying chain letter to each of those subunit chains (i.e, from A to G).without having to manually copy and paste columns of chain letters into the pdb text file.<br>
&gt;<br>
&gt; This way when i scroll over each pdb chain in Chimera  i will be able to see the chain letter too.<br>
&gt;<br>
&gt; Can this chain letter ID assignment be done directly in Chimera?..... and if so,  how and which tool do i need to use.?<br>
&gt; Thank you for your assistance.<br>
&gt; Ti<br>
&gt;<br>
<br>
</span>Dear Ti,<br>
I think you can use the “Change Chain IDs” tool (in menu under Tools… Structure Editing). If I recall correctly, even though you don’t already have chain IDs, the parts separated by TER will be listed separately in the dialog and you can specify a new ID for each.<br>
&lt;<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/editing/changechains.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/editing/changechains.html</a>&gt;<br>
<br>
There is also a “changechains” to do basically the same thing, but it only handles chains that already have IDs that are different from each other.<br>
&lt;<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/midas/changechains.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/midas/changechains.html</a>&gt;<br>
<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>
P.S. we generally recommend sending questions to the chimera-users list, CC’d here<br>
<br>
<br>
</blockquote></div><br></div>