<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none"><!-- p { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:14pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:'Times New Roman',Times,serif;">
<p>Hello,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>I have a protein of interest that I need to perform molecular docking on by multiple ligands (~1000,000).<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>The protein is in PDB file format, while ligands are in a&nbsp;SDF file format.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Initially, the ligands were divided into multiple SDF&nbsp;files (mini)&nbsp;for hardware sake.&nbsp;</p>
<p>Then, a&nbsp;python script was developed to handle the docking of each mini&nbsp;SDF file against the protein of interest.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>This works nicely, however docking scores (tables)&nbsp;have no ligands IDs associated to distinguish each score.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>So, basically I have scoring tables without any key&nbsp;IDs!!<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Kindly, I want to know if you have encountered the same problem and what approach you took&nbsp;to solve this.</p>
<p><br>
</p>
<p>&nbsp;<br>
</p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
<div style="font-size:16px; margin-top:0px; margin-bottom:0px"><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="4"><span style="font-size:16px"><font face="DaunPenh,sans-serif"><span style="font-size:20pt"><b><font size="3">Thanks,</font>&#8203;</b></span></font></span></font></div>
<div style="font-size:16px; margin-top:0px; margin-bottom:0px"><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="2"><span style="font-size:16px"><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:14.67px">______________________________</span></font><br>
<font face="Calibri,sans-serif" color="#4BA524"><b>Turki Sobahy</b></font><br>
<font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><b>Research Associate</b></span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><br>
</span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><b>Research Center&nbsp;(J-04)</b></span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><br>
</span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><b>King Faisal Specialist Hospital</b></span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><br>
</span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><b>&amp; Research Center&nbsp;(Gen.Org.)-Jeddah Branch&nbsp;</b></span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><br>
</span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><b><i>PO Box 40047, Jeddah 21499, Saudi Arabia</i></b></span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><i><br>
</i></span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><b><i>Tel#&nbsp;&#43;966&nbsp;667 7777 ext. 66736| MCD# 40716</i></b></span></font></span></font></div>
<div style="font-size:16px; margin-top:0px; margin-bottom:0px"><font face="Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif" size="2"><span style="font-size:16px"><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><b><i>Mobile# &#43;966 505837027<br>
</i></b></span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#282828" size="2"><span style="font-size:11pt"><b>email&nbsp;</b></span></font><font face="Calibri,sans-serif" color="#006FC9" size="2"><span style="font-size:11pt"><b><u>tsobahy</u></b></span></font><a target="_blank" href="mailto:ESan-Diego@kfshrc.edu.sa" tabindex="0" id="NoLP"><font face="Calibri,sans-serif" color="#006FC9" size="2"><span style="font-size:11pt"><b>@kfshrc.edu.sa</b></span></font></a></span></font></div>
</div>
</div>
</body>
</html>