<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">Dear Henrique,<div class="">You can use the “shape triangle” command to draw a triangle with three specified atoms at the points. &nbsp;You’d open the structure and then specify the 3 atoms (either by name and residue number, or by selection) in the command.</div><div class=""><br class=""></div><div class="">For example, commands:</div><div class=""><br class=""></div><div class="">open 4ysa</div><div class="">shape triangle atoms :401.A@CU:143.A@ND1:148.A@SD color sky blue</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Or it may be easier for you to use selection instead of giving the residue numbers and atom names. &nbsp;Just Ctrl-click the first atom and then Shift-Ctrl-click the second and third atoms. &nbsp;When you have the three atoms you want selected, you could use this simpler command:</div><div class=""><br class=""></div><div class="">shape triangle atoms sel color orange</div><div class="">~select</div><div class=""><br class=""></div><div class="">… where ~select just clears (deselects) the selection. &nbsp;Details of “shape triangle”:</div><div class="">&lt;<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/midas/shape.html#triangle" class="">http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/midas/shape.html#triangle</a>&gt;</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Example image attached below. &nbsp;The triangles are created as new models listed in the Model Panel, and you can hide or close them. &nbsp;Maybe it would work to make two triangles for your Cu2O2 case.</div><div class=""><br class=""></div><div class="">A completely different way would be to create a BILD format text file with “.polygon” descriptions &nbsp;of triangles and reading it in to Chimera. &nbsp;However, that is usually more bother since it requires creating a separate file. &nbsp;BILD format:</div><div class="">&lt;<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/bild.html" class="">http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/bild.html</a>&gt;</div><div class=""><br class=""></div><div class="">I hope this helps,</div><div class="">Elaine<br class=""><div class="">----------<br class="">Elaine C. Meng, Ph.D.&nbsp;<br class="">UCSF&nbsp;Computer&nbsp;Graphics&nbsp;Lab&nbsp;(Chimera&nbsp;team)&nbsp;and&nbsp;Babbitt&nbsp;Lab<br class="">Department&nbsp;of&nbsp;Pharmaceutical&nbsp;Chemistry<br class="">University&nbsp;of&nbsp;California,&nbsp;San&nbsp;Francisco<br class=""><br class=""><img height="338" width="407" apple-width="yes" apple-height="yes" apple-inline="yes" id="65F58963-EC4D-4F70-8B3A-77C68B052F9F" src="cid:3451485B-DC20-4C4E-A0FA-32B8B21A7816@compbio.ucsf.edu" class=""></div><br class=""><blockquote type="cite" class="">On Mar 8, 2016, at 5:23 AM, Henrique C. S. Junior &lt;<a href="mailto:henriquecsj@gmail.com" class="">henriquecsj@gmail.com</a>&gt; wrote:<br class=""><br class="">Dear Chimera list,<br class="">As a inorganic chemist sometimes I have to deal with a variety of bridges (see image attached for an example) and it'd be very useful&nbsp;and didactic if I could create a little plane (like a distorted square) inside this bridges to mark different properties.<br class="">Is this possible in Chimera?<br class=""><br class="">Thank you in advance.<br class=""></blockquote><br class=""></div></body></html>