<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    OK. So I've managed to 'resolve' this. Though it will not work if I
    install 'colorbrewer' on my system.<br>
    <br>
    The solution is to set a .pth file in the system site-packages
    folder e.g. chimera.pth with the path to Chimera site-packages (e.g.
/Applications/Chimera.app/Contents/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages)<br>
    <br>
    That did it for me.<br>
    <br>
    Paul<br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 16/02/2016 12:08, Paul Kibet Korir
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote cite="mid:56C31120.8010701@ebi.ac.uk" type="cite">
      <meta http-equiv="content-type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      Hi,<br>
      <br>
      I want to use the chimera API and I've managed to configure a
      successful import of chimera except that I get that colorbrewer is
      not installed. <br>
      <br>
      &gt;&gt;&gt; import chimera<br>
      Traceback (most recent call last):<br>
        File "&lt;stdin&gt;", line 1, in &lt;module&gt;<br>
        File
      "/Applications/Chimera.app/Contents/Resources/share/chimera/__init__.py",

      line 73, in &lt;module&gt;<br>
          import palettes<br>
        File
      "/Applications/Chimera.app/Contents/Resources/share/chimera/palettes.py",

      line 103, in &lt;module&gt;<br>
          _initPresets()<br>
        File
      "/Applications/Chimera.app/Contents/Resources/share/chimera/palettes.py",

      line 95, in _initPresets<br>
          from colorbrewer import ColorBrewer<br>
      ImportError: cannot import name ColorBrewer<br>
      <br>
      What is the right way to go about this? (I could create a symbolic
      link to my system colorbrewer, but that doesn't seem clean).<br>
      <br>
      <div class="moz-signature">-- <br>
        With kind regards,<br>
        <br>
        <strong>Paul K Korir, PhD</strong><br>
        <i>Scientific Programmer</i><br>
        EMBL-EBI<br>
        Main Building, A2-35,<br>
        WTGC, Hinxton, Cambridge CB10 1SD<br>
        P: +44 1223 49 44 22<br>
        F: +44 1223 49 44 68</div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Chimera-users mailing list: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>
Manage subscription: <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
    <div class="moz-signature">-- <br>
      With kind regards,<br>
      <br>
      <strong>Paul K Korir, PhD</strong><br>
      <i>Scientific Programmer</i><br>
      EMBL-EBI<br>
      Main Building, A2-35,<br>
      WTGC, Hinxton, Cambridge CB10 1SD<br>
      P: +44 1223 49 44 22<br>
      F: +44 1223 49 44 68</div>
  </body>
</html>