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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hi, <o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">I am a beginner in using Chimera. I have a simple question for you experts and I really appreciate any guide for me.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">I am working on a project needs to create a one-to-one mapping between MRC grid and PDB atoms. For example, from the PDB file, I know the physical coordinates of each atom.&nbsp; I want to know whether each atom is out of the 3D volume of MRC
 or not. &nbsp;If it is inside the volume, I hope to know which voxel grid this atom is in.
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">I have figured out the mapping between the physical origin of PDB system and its grid index in MRC using Chimera Volume Viewer -- &gt; Features ---&gt; Coordinates ----&gt; Origin Index.&nbsp; But I am not sure whether the information of &#8216;Rotation axis&#8217;
 is also very important, which is usually [0,0,1] in &nbsp;Chimera Volume Viewer -- &gt; Features ---&gt; Coordinates ----&gt; Rotation axis.&nbsp;
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thank you very much.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Best,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Rongjian<span style="font-size:12.0pt"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
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