
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>

</head>

<body dir="ltr">

<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">

<p>thanks. </p>

<p>suggestion on feature</p>

<p><br>

</p>

<p>when exiting session, chimera auto writes out a csv file of model id, name and path. file name equals session name with csv extension. The file could be incorporated into a database.</p>

<p><br>

</p>

<p>Would make organizing assets & archiving session files easier.</p>

<p><br>

</p>

<div id="Signature">

<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">

<div class="BodyFragment"><font size="2">

<div class="PlainText">Matthew Dougherty<br>

National Center for Macromolecular Imaging<br>

Baylor College of Medicine<br>

<span style="font-size:13.0pt; font-family:Calibri">=================================================</span><br>

</div>

<div class="PlainText"><span style="font-size:13pt; font-family:Calibri">=================================================</span><span style="font-size:13.0pt; font-family:Calibri"><br>

</span></div>

</font></div>

</div>

</div>

<br>

<br>

<div style="color: rgb(0, 0, 0);">

<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">

<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Eric Pettersen <pett@cgl.ucsf.edu><br>

<b>Sent:</b> Friday, October 9, 2015 5:37 PM<br>

<b>To:</b> Dougherty, Matthew T<br>

<b>Cc:</b> chimera-users@cgl.ucsf.edu<br>

<b>Subject:</b> Re: [Chimera-users] python/model panel</font>

<div> </div>

</div>

<div><br class="">

<div>

<blockquote type="cite" class="">

<div class="">On Oct 9, 2015, at 1:34 PM, Dougherty, Matthew T <<a href="mailto:matthewd@bcm.edu" class="">matthewd@bcm.edu</a>> wrote:</div>

<br class="Apple-interchange-newline">

<div class="">

<div id="divtagdefaultwrapper" class="" style="font-style:normal; font-variant:normal; font-weight:normal; letter-spacing:normal; line-height:normal; orphans:auto; text-align:start; text-indent:0px; text-transform:none; white-space:normal; widows:auto; word-spacing:0px; font-size:12pt; background-color:rgb(255,255,255); font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">

<div class="" style="margin-top:0px; margin-bottom:0px">I would like to print out the model ID, name and input files as they are listed in the model panel.</div>

<div class="" style="margin-top:0px; margin-bottom:0px"><br class="">

</div>

<div class="" style="margin-top:0px; margin-bottom:0px">Can you point me in the direction of how to loop over the model panel ?</div>

<div class="" style="margin-top:0px; margin-bottom:0px">Such as elevant variables, and what would be a block of code in chimera that I should study. </div>

</div>

</div>

</blockquote>

<br class="">

</div>

<div>Hi Matt,</div>

<div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"></span>I don’t know that you need to go through the Model Panel per se, you could just go through Chimera’s open models list:</div>

<div><br class="">

</div>

<div>chimera.openModels.list()</div>

<div><br class="">

</div>

<div><br class="">

</div>

<div>Each model in the list has:</div>

<div><br class="">

</div>

<div>id<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"> </span>ID number</div>

<div>subid<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"> </span>Sub-ID number (None if it doesn’t have a sub-ID)</div>

<div>name<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"> </span>Name</div>

<div>openedAs<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"> </span>If it came from a file, a 4-tuple of stuff you mostly don’t care about, but the first element is the file name</div>

<div><br class="">

</div>

<div>Since some models don’t come from files (e.g. on-the-fly VRML models), you may want to use the model panel’s “inputPath” function to always get a usable/readable string:</div>

<div><br class="">

</div>

<div>from ModelPanel import inputPath</div>

<div>path = inputPath(model)</div>

<div><br class="">

</div>

<div>—Eric</div>

<br class="">

<div class="">

<div class="">

<div class="" style="word-wrap:break-word">

<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"></span>Eric Pettersen</div>

<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"></span>UCSF Computer Graphics Lab</div>

<div class=""><br class="">

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</body>

</html>