<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif">Hi,</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif">I am interested on calculating the electrostatic potential of a molecular surface on a protein (specifically visualizing that potential on a previously cavity determined by CASTp). However, althought I did get reasonable results using Coulombic potential, I could not obtain similar results using APBS potential (I obtained a surface too electrostatic, charged negatively and the values have a huge range, not only from -10 to 10 as in the case of Coulombic potential). Should I modify some default values out of the calculation parameters in order to get a similar result to that obtain by Coulombic potential? And it is absolutely indispensable add hydrogens in an APBS estimation?</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif">Thanks in advance for your help.</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif">Best regards,</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif"><br></div><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div><font face="verdana, sans-serif"><b>Andrés Felipe Vásquez J., <i>BSc, MSc.</i></b><br>Grupo de Fisiología Molecular</font></div><div><font face="verdana, sans-serif">Subdirección de Investigación Científica y Tecnológica</font></div><div><font face="verdana, sans-serif">Dirección de Investigación en Salud Pública<br>Instituto Nacional de Salud<br>Avenida calle 26 No. 51-20 - Zona 6 CAN</font></div><div><font face="verdana, sans-serif">+57 (1) 2207700 ext. 1419</font></div><div><font face="verdana, sans-serif">Bogotá, D.C., Colombia<span style="font-size:small"> </span></font><br></div></div></div></div></div>
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