<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=us-ascii">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 14.02.5004.000">
<TITLE>surfaces and</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/rtf format -->

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">I have been working with a very large structure of many subunits, the E.Coli Ribosome particle with the Signal Recognition Particle attached (PDB 2J28)</FONT></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">I</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"> <FONT FACE="Calibri">was able to</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri"> create an image of the SRP part of the complex. I selected that subunit.</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri"> And</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"> <FONT FACE="Calibri">was able</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"> <FONT FACE="Calibri">to hide all the other subunits. So with the subunit selected I tried to visualize</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"> <FONT FACE="Calibri">only that image</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri"> as a surface. Wouldn</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">&#8217;t let me, getting an error message that it was too large and I should somehow split it.&nbsp; Don&#8217;t know how to do that.</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri"> I know the whole dataset is very large, but the SRP portion is only 400 amino acids.</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">A work around would be if I could somehow select the SRP subunit and have it as a dataset to reload as that subunit alone. Then not so big.&nbsp; Don</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">&#8217;t know how to do that either.</FONT></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">Your suggestions. I couldn&#8217;t find anything in the tutorials that might help. </FONT></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">I was able to show the surface of another PDB file that was much smaller.</FONT></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">Arthur G. Szabo</FONT></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">Prof</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">essor Emeritus</FONT></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">Chemistry</FONT></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">Wilfrid Laurier University</FONT></SPAN></P>

<P DIR=LTR><SPAN LANG="en-ca"><FONT FACE="Calibri">Waterloo Ontario Canada.</FONT></SPAN><SPAN LANG="en-ca"></SPAN></P>

</BODY>
</HTML>