<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=iso-8859-1"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">Hi Alex,<div class=""><br class=""></div><div class="">&nbsp; Surfnet in Chimera does not produce a volume, only surfaces. &nbsp;It calculates the volume but then computes surfaces and deletes the volume. &nbsp;If you would to measure the enclosed volume of the disconnected pieces produced by surfnet, first make those pieces independently selectable with command</div><div class=""><br class=""></div><div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>sop split #0</div><div class=""><br class=""></div><div class="">where #0 is the id for the surfnet model (use Favorites / Model Panel to find the correct id number). &nbsp;Then select the piece of interest (ctrl click on it), then get its enclosed volume with command</div><div class=""><br class=""></div><div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>measure volume sel</div><div class=""><br class=""></div><div class="">To type commands to Chimera use menu Favorites / Command Line.</div><div class=""><br class=""></div><div class="">&nbsp; This question belongs on the chimera-users mailing list, not the chimera-dev list which is for programming issues.</div><div class=""><br class=""></div><div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>Tom</div><div class=""><br class=""><div><blockquote type="cite" class=""><div class="">On May 6, 2015, at 8:18 AM, Alex &nbsp;wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class=""><div dir="ltr" style="font-family: Calibri; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">Dear Sirs,<br class="">I recently started using chimera, please apologise my lack of knowledge.<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><br class="">In order to erase a surfnet volume I am trying to use the Erase volume module, but it doesn't work. Are the surfnet objects available to be used in VolumeEraser functions? Is there another way to study volume intersections?<br class="">If you know, please point out the article which describes the procedure for this kind of volume calculation.<br class=""><br class="">Best regards,<br class="">Alex<br class=""></div><span style="font-family: Calibri; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Calibri; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class=""><span style="font-family: Calibri; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">Chimera-dev mailing list</span><br style="font-family: Calibri; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class=""><a href="mailto:Chimera-dev@cgl.ucsf.edu" style="font-family: Calibri; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">Chimera-dev@cgl.ucsf.edu</a><br style="font-family: Calibri; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class=""><a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-dev" style="font-family: Calibri; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-dev</a></div></blockquote></div><br class=""></div></body></html>