<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Dear Chimera users,<br><br></div>I am trying to convert sdf file ( downloaded from<u> diversity set</u> data from '<a href="http://scs.illinois.edu/htsf/compound_collection/nci.php">http://scs.illinois.edu/htsf/compound_collection/nci.php</a>') into mol2 format. When I ran the command chimera --nogui processSDF.py<br></div>as given the previous posting ( <a href="http://www.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimera-users/2010-March/004974.html">http://www.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimera-users/2010-March/004974.html</a>), I got the following error messages:<br>Cannot find consistent set of bond orders for ring system containing atom #0.73:1@N1<br>---<br>Unknown redo atom type: N3<br>Traceback (most recent call last):<br><br></div>Any suggestions for correcting these errors will be a good help for me.<br><br></div>Thank you,<br></div>Mahendra Thapa<br></div>University of Cincinnati,OH<br></div>