<div dir="ltr">Dear Sir.<div><br></div><div>I&#39;m Enrico Ronca a post-doc researcher at the National Research Council of Italy in Perugia.</div><div><br></div><div>I&#39;m contacting you because I often work with metal atoms and not always chimera show me bonds.</div><div>I solved the problem removing all bonds and pseudo bonds and adding &quot;reasonable bond between selected atoms&quot; in the adjust bonds menu of chimera.</div><div><br></div><div>Is there a way to run the same procedure from the command line so that I could automate it by a script?</div><div><br></div><div>Thank you in advance for your reply.</div><div><br></div><div>I&#39;m looking forward to hearing from you</div><div><br></div><div>Enrico</div><div><br></div></div>