To<br>Elaine Meng,<br>May be I didn't explain properly. Most UniprotKB database entries have used Modbase in the 3D structure database section. In any entry where Modbase is used, clicking on search button next to the&nbsp; Modbase entry used to open that structure entry page using Chimera. With the current version that doesn't seem to happen (as it was happening with the earlier versions). Please advice.<br>Thanking You,<br>Debasish Banerjee<br><br><br><br><br>From: Elaine Meng &lt;meng@cgl.ucsf.edu&gt;<br>Sent: Wed, 26 Nov 2014 23:02:40 <br>To: Debasish Banerjee &lt;dbanerjee@banerjee.net.in&gt;<br>Cc: Mailing List &lt;chimera-users@cgl.ucsf.edu&gt;<br>Subject: Re: [Chimera-announce] new Chimera release (v1.10)<br>On Nov 25, 2014, at 4:17 PM, Debasish Banerjee &lt;dbanerjee@banerjee.net.in&gt; wrote:<br>
<br>
&gt; To,<br>
&gt; Elaine Meng,<br>
&gt; I had downloaded Chimara 1.10 but it doesn't seem to operate on other sites like UniprotKB. Can you please comment.<br>
&gt; Debasish Banerjee<br>
<br>
<br>
Dear Debasish Banerjee,<br>
Not sure I understand your question. &nbsp;UCSF Chimera is a molecular modeling/graphics program that you use on your own computer. <br>
<br>
The only relationship to UniProtKB is that you can fetch sequences and annotations from that site while using Chimera. &nbsp;Maybe you mean you had trouble fetching data from the web (Chimera menu: File… Fetch by ID)? &nbsp;<br>
<br>
We haven’t heard reports of a problem. &nbsp;For example, I can start UCSF Chimera 1.10, use menu: File… Fetch by ID, choose database “UniProt” and then get the sequence for NGF_HUMAN shown in Chimera. &nbsp;Of course, you have to be connected to the internet. &nbsp;Otherwise, if you have some specific problem you can use Chimera menu: Help… Report a Bug and give enough information about the steps you tried so that somebody else could reproduce it.<br>
<br>
Best,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D. &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; <br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>