<div dir="ltr"><div><div><div><div>Dear Mr/Ms,<br></div>¬†Good morning. My name is Tommy from San Diego Biomedical Research Institute. I am currently learning to use the chimera software. Great work in creating a program for protein and DNA visualization.<br><br>I have one question to ask regarding the subject above. Is there a way to manually add sugar component onto an existing pdb file?<br><br></div>To be precise, I am currently working with HIV-1 envelope. I have the pdb files that features the structure of HIV-1 trimer Env. I wanted to add glycan at specific sites to show steric hindrance to antibody binding.<br><br></div><div>Another question.<br>Is there a way to superimpose 2 pdb files into one image? For example, I have one pdb file for HIV-1 Env and another pdb file for antibody. Can I &quot;merge&quot; these two pdb files as one image?<br><br></div><div>Also, assuming that it is possible to &quot;merge&quot; two different pdb into one image, is there a way to rotate one protein without affect the orientation of the other protein?<br><br></div>Any advice/tip is greatly appreciated.<br></div>Thank you.<br><br>Sincerely,<br>Tommy<br><div><br></div></div>