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<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">Dear users,</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">I have used chimera
to draw ellipsoid to represent each domain in a protein structure
using the measure inertia command in an attempt to visualize the
orientation of one domain with respect to the other. This has been
done for a set of homologous structures of the same protein. 
</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><br>
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<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">Now I want to
visualize the axes of the ellipsoid of the two domains. Can anybody
please suggest me on how to do it ?</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">      
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<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">Also Is there any
way to quantitate the angle between the two ellipsoid representing
the two domains in  a protein ?</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><br>
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<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">Thanking you,</p>
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<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">with regards,</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">Anu</p></div>