<div dir="ltr">OK, for molecule 18801-18802<div><br></div><div>@/serialNumber&gt;18800 and serialNumber&lt;18803</div><div><br></div><div>it remains to be seen if it can be used to define a centroid</div><div>fp<br><div class="gmail_quote">---------- Forwarded message ----------<br>From: <b class="gmail_sendername">Francesco Pietra</b> <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:chiendarret@gmail.com">chiendarret@gmail.com</a>&gt;</span><br>Date: Sun, Oct 12, 2014 at 7:05 AM<br>Subject: command @/serialNumber=#<br>To: chimera &lt;<a href="mailto:chimera-users@cgl.ucsf.edu">chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>&gt;<br><br><br><div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div><div>Hello:<br></div>I wonder whether it is possible to extend the command<br><br></div>sel @/serialNumber=18801 (as an example of a particular serial number)<br><br></div>to comprise a range of atoms. So as to cover, for example, an entire ligand, may be dioxygen, 18801-18802. And whether that could be extended to define a centroid.<br><br></div>it is implied that I have prepared a large system based on segname (charmm ff with namd), which is not dealt with by chimera.<br><br></div>thanks<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br></font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">francesco pietra<br></font></span><br></div>PS: I can follow the ligand by defining the centroid for a single atom of the ligand. This would be my last resource.<br></div>
</div><br></div></div>