<div dir="ltr">thanks v much, I'll give that a go...</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 9 October 2014 18:46, Elaine Meng <span dir="ltr"><<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu" target="_blank">meng@cgl.ucsf.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Jane,<br>
I think you just wanted to apply the "heteroatom" color-coding to that residue.  For example, select it and use<br>
<br>
menu: Actions… Color.. by heteroatom<br>
or<br>
command: color byhet sel<br>
<br>
That will keep the carbons as their current color but use the element color-coding for the others.  Or, you could use "by element"  instead, which will also color the carbons by element (gray).<br>
<<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/colortables.html#byelement" target="_blank">http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/colortables.html#byelement</a>><br>
<br>
If I misunderstood your question, you could try asking it again.  I hope this helps,<br>
Elaine<br>
----------<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<br>
On Oct 9, 2014, at 4:40 AM, Jane Norman <<a href="mailto:Jane.Norman@bristol.ac.uk">Jane.Norman@bristol.ac.uk</a>> wrote:<br>
<br>
> Hello<br>
><br>
> I am new to using chimera and I have been struggling with one aspect. I'm trying to mutate one residue in my protein, by using the command swapaa leu :310, this seems to work nicely,<br>
><br>
> To show the amino acid I then go in to "tools" then "sequence" and select this mutated residue and then go to "actions" then "atoms/bond" and "show" and the residue is displayed, however it is displayed as a block colour which I can't seem to change the colour scheme of the amino acid to match other residues which I've displayed nearby (e.g showing different colours (white/blue/red for different groups on the amino acid). i can easily change the block coulr of the whole reside but not to match the helpful scheme of he other displayed residues.<br>
><br>
> However If I just pick an unmutated residue to display it shows it in the same style as the other residues (which is what I want for my mutated one)<br>
><br>
> I hope that makes sense I couldn't find the answer in the help section<br>
><br>
> Thank you very much for your time<br>
><br>
> Jane<br>
<br>
</blockquote></div><br></div>