Dear Chimera Design Team,<div><br></div><div>We have been using Chimera 8.1 and autodock-vina for small molecule and protein interaction analysis. We came across a protein structure (PDB code 2vfs) with a co-factor FAD enclosed. We would like to know if we could dock a sugar into the substrate binding site with the FAD molecule in situ. &nbsp;Thank you for your help.</div><br><span>--<br>Ching Song, Ph.D.<div>Department of Biological Science and Engineering<br><div>School of Chemistry and Biological Engineering</div></div><div>University og Science and Technology Beijing</div><div>Xue Yuan Lu 30, Li Hua Lou Room 111</div><div>Hai Dian District</div><div>Beijing 100083, P. R. China</div><div>86-10-62334497</div></span>