<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=us-ascii"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><div>On Sep 29, 2014, at 7:27 AM, Tony Lewis &lt;<a href="mailto:t.lewis@ucl.ac.uk">t.lewis@ucl.ac.uk</a>&gt; wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div dir="ltr"><div><div><div><div>Dear Chimera people,<br><br></div><div>Many thanks to all Chimera contributors.<br><br>Please may I propose an addition to allow users to access our CATH domains in the same way that they can currently access SCOP domains ( <a href="https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/scop.html">https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/scop.html</a> )?<br><br></div><div></div><div>PDBs for CATH domains can be loaded from URI's of the form: <a href="http://data.cathdb.info/latest_release/pdb/1cukA01">http://data.cathdb.info/latest_release/pdb/1cukA01</a><br><br></div><div></div><div>For information, CATH domain IDs contain 7 digits:<br></div><ul><li><span style="font-family:courier new,monospace">1-4 : (eg 1cuk ) : PDB code <br></span></li><li><span style="font-family:courier new,monospace">&nbsp; 5 : (eg A&nbsp;&nbsp;&nbsp; ) : chain code</span></li><li><span style="font-family:courier new,monospace">6-7 : (eg 01&nbsp;&nbsp; ) : 2-digit domain number ( '00' for whole chain domains )</span></li></ul></div><div><div></div><div>We here at CATH would be very happy to provide any other information required to implement this.</div></div></div></div></div></blockquote><br></div><div>Hi Tony,</div><div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>I've added CATH fetching to Chimera and it will show up in the tonight's daily build. &nbsp;Look for builds dated September 27 or later. &nbsp;The above information was sufficient. &nbsp;Let me know if you find any rough edges. :-)</div><div><br></div><div>--Eric</div><br><div apple-content-edited="true">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-align: auto; -khtml-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -apple-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><p style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><font face="Helvetica" size="5" style="font: 16.0px Helvetica"><span class="Apple-converted-space">&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></span>Eric Pettersen</font></p><p style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><font face="Helvetica" size="5" style="font: 16.0px Helvetica"><span class="Apple-converted-space">&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></span>UCSF Computer Graphics Lab</font></p><p style="margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px"><font face="Helvetica" size="5" style="font: 16.0px Helvetica"><span class="Apple-converted-space">&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;</span><a href="http://www.cgl.ucsf.edu">http://www.cgl.ucsf.edu</a></font></p><br class="Apple-interchange-newline"></span>
</div>
<br></body></html>