<div dir="ltr"><div>Hi,<br></div>  I want to to a potential energy scan of a dihedral (of a small organic molecule) by setting a dihedral angle, fixing those atoms involved, and doing a minimization. Then incrementing the angle and repeating. I can currently do all of this by using the gui (set torsion angle in build_structure,minimize with selected atoms fixed , then save and edit the final energies for each angle in reply log). I'm sure that this can be done with python. I am wondering if there is an available script to do this all.  As input I would have a set of torsion angles and as output I would like a table of angle and energy.<br clear="all">

<div><div><br>-- <br><div dir="ltr">-- Milo<br>===================================================<br>National Magnetic Resonance Facility at Madison<br>      An NIH-Supported Resource Center<br><br>W. Milo Westler, Ph.D.<br>

<br>NMRFAM Director<br>Senior Scientist<br>       and<br>Adjunct Professor<br>Department of Biochemistry<br>University of Wisconsin-Madison<br>DeLuca Biochemistry Laboratories<br>433 Babcock Drive<br>Rm B160D<br>Madison, WI USA 53706-1544<br>

EMAIL: <a href="mailto:milo@nmrfam.wisc.edu" target="_blank">milo@nmrfam.wisc.edu</a><br>PHONE: (608)-263-9599<br>FAX: (608)-263-1722<br>======================================================================= ========</div>


</div></div></div>