<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div><div><div>Hallo:<br></div>I am trying to replay some old movie of molecular dynamics trajectories (Amber prmtop/dcd). At that time (a couple of years ago I had Chimera of those times) I get the following error message<br>
<br></div>IOError: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!<br><br></div>File<br></div>"/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>
<br></div>raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!<br><br></div>See reply log for Python traceback.<br><br>The latter reads:<br><type 'exceptions.IOError'> Exception in Tk callback<br>
  Function: <function command at 0x315ccf8> (type: <type 'function'>)<br>  Args: ()<br>Traceback (innermost last):<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/lib/python2.7/site-packages/Pmw/Pmw_1_3/lib/PmwBase.py", line 1747, in __call__<br>
    return apply(self.func, args)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 449, in command<br>    getattr(s, buttonFuncName(txt))()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 704, in OK<br>
    self.Apply()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/EnsembleLoader.py", line 92, in Apply<br>    self.callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 60, in loadEnsemble<br>
    callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 73, in loadEnsemble<br>    ensemble = Prmtop_Traj(prmtop, trajectory, startFrame, endFrame)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 191, in __init__<br>
    self.trajectory.addFile(trajectory)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/__init__.py", line 183, in addFile<br>    self.trajs.append(self.addFunc(trajFile))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 190, in <lambda><br>
    lambda f: Trajectory(self.prmtop, f))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 264, in __init__<br>    self.SetupFrame()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>
    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br><type 'exceptions.IOError'>: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br>
<br>IOError: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br><br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br>
<br>See reply log for Python traceback.<br><br><br><type 'exceptions.IOError'> Exception in Tk callback<br>  Function: <function command at 0x4732230> (type: <type 'function'>)<br>  Args: ()<br>
Traceback (innermost last):<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/lib/python2.7/site-packages/Pmw/Pmw_1_3/lib/PmwBase.py", line 1747, in __call__<br>    return apply(self.func, args)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 449, in command<br>
    getattr(s, buttonFuncName(txt))()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 704, in OK<br>    self.Apply()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/EnsembleLoader.py", line 92, in Apply<br>
    self.callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 60, in loadEnsemble<br>    callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 73, in loadEnsemble<br>
    ensemble = Prmtop_Traj(prmtop, trajectory, startFrame, endFrame)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 191, in __init__<br>    self.trajectory.addFile(trajectory)<br>
  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/__init__.py", line 183, in addFile<br>    self.trajs.append(self.addFunc(trajFile))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 190, in <lambda><br>
    lambda f: Trajectory(self.prmtop, f))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 264, in __init__<br>    self.SetupFrame()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>
    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br><type 'exceptions.IOError'>: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br>
<br>IOError: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br><br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br>
<br>See reply log for Python traceback.<br><br><br><type 'exceptions.IOError'> Exception in Tk callback<br>  Function: <function command at 0x4632758> (type: <type 'function'>)<br>  Args: ()<br>
Traceback (innermost last):<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/lib/python2.7/site-packages/Pmw/Pmw_1_3/lib/PmwBase.py", line 1747, in __call__<br>    return apply(self.func, args)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 449, in command<br>
    getattr(s, buttonFuncName(txt))()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 704, in OK<br>    self.Apply()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/EnsembleLoader.py", line 92, in Apply<br>
    self.callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 60, in loadEnsemble<br>    callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 73, in loadEnsemble<br>
    ensemble = Prmtop_Traj(prmtop, trajectory, startFrame, endFrame)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 191, in __init__<br>    self.trajectory.addFile(trajectory)<br>
  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/__init__.py", line 183, in addFile<br>    self.trajs.append(self.addFunc(trajFile))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 190, in <lambda><br>
    lambda f: Trajectory(self.prmtop, f))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 264, in __init__<br>    self.SetupFrame()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>
    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br><type 'exceptions.IOError'>: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br>
<br>IOError: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br><br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br>
<br>See reply log for Python traceback.<br><br><br><type 'exceptions.IOError'> Exception in Tk callback<br>  Function: <function command at 0x3bd6500> (type: <type 'function'>)<br>  Args: ()<br>
Traceback (innermost last):<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/lib/python2.7/site-packages/Pmw/Pmw_1_3/lib/PmwBase.py", line 1747, in __call__<br>    return apply(self.func, args)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 449, in command<br>
    getattr(s, buttonFuncName(txt))()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 704, in OK<br>    self.Apply()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/EnsembleLoader.py", line 92, in Apply<br>
    self.callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 60, in loadEnsemble<br>    callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 73, in loadEnsemble<br>
    ensemble = Prmtop_Traj(prmtop, trajectory, startFrame, endFrame)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 191, in __init__<br>    self.trajectory.addFile(trajectory)<br>
  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/__init__.py", line 183, in addFile<br>    self.trajs.append(self.addFunc(trajFile))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 190, in <lambda><br>
    lambda f: Trajectory(self.prmtop, f))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 264, in __init__<br>    self.SetupFrame()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>
    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br><type 'exceptions.IOError'>: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br>
<br>IOError: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br><br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br>
<br>See reply log for Python traceback.<br><br><br><type 'exceptions.IOError'> Exception in Tk callback<br>  Function: <function command at 0x46cb488> (type: <type 'function'>)<br>  Args: ()<br>
Traceback (innermost last):<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/lib/python2.7/site-packages/Pmw/Pmw_1_3/lib/PmwBase.py", line 1747, in __call__<br>    return apply(self.func, args)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 449, in command<br>
    getattr(s, buttonFuncName(txt))()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/chimera/baseDialog.py", line 704, in OK<br>    self.Apply()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/EnsembleLoader.py", line 92, in Apply<br>
    self.callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 60, in loadEnsemble<br>    callback)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/__init__.py", line 73, in loadEnsemble<br>
    ensemble = Prmtop_Traj(prmtop, trajectory, startFrame, endFrame)<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 191, in __init__<br>    self.trajectory.addFile(trajectory)<br>
  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/__init__.py", line 183, in addFile<br>    self.trajs.append(self.addFunc(trajFile))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 190, in <lambda><br>
    lambda f: Trajectory(self.prmtop, f))<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 264, in __init__<br>    self.SetupFrame()<br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>
    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br><type 'exceptions.IOError'>: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br>
<br>IOError: Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!<br><br>  File "/opt/UCSF/Chimera64-1.7/share/Trajectory/formats/Amber/Amber.py", line 354, in SetupFrame<br>    raise IOError, "Trajectory/Restart header line is greater than 80 characters -- invalid!!"<br>
<br>See reply log for Python traceback.<br><br><br><br><br></div>Thanks for advice as to reply those movies<br><br></div>francesco pietra<br><div><div><br></div></div></div>