<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Thomas,<div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">     </span>In your openModels.open() call you need to tell Chimera what type of file it is since it has no prefix or suffix.  So change it from openModels.open('2OID') to openModels.open('2OID', type='PDBID').</div><div><br></div><div>--Eric</div><div><div><br>                        Eric Pettersen<br>                        UCSF Computer Graphics Lab<br>                        <a href="http://www.cgl.ucsf.edu">http://www.cgl.ucsf.edu</a><br><br></div><div><div>On Aug 2, 2014, at 12:33 PM, Thomas Hrabe <<a href="mailto:thrabe@sanfordburnham.org">thrabe@sanfordburnham.org</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">

<div>
<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:10pt;">
<div class="PlainText">Sorry, I didnt realize I sent the pyc file. Hereís the py file<br>
<br>
<br>
</div>
</span></font></div>
<div class="BodyFragment"><font size="2"><span style="font-size:10pt;">
<div class="PlainText"><br>
<br>
<br>
On Aug 2, 2014, at 12:29 PM, Elaine Meng <<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu">meng@cgl.ucsf.edu</a>> wrote:<br>
<br>
> Hi Thomas,<br>
> This is a little out of my area, but my understanding is that the filename extension .py or .pyc will be recognized automatically as Python.  I find this is true for .py as well as my locally (on this computer) generated .pyc files, but not for the file that
 you sent.  I donít know what is different about the file you sent, or whether it could be ascribed to .pyc not being compatible between different platforms.<br>
> <br>
> Hereís the list of Chimera filetypes and corresponding filename suffixes (and prefixes that could be used in the open command when the suffix isnít present):<br>
> <<a href="http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/filetypes.html">http://www.rbvi.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/filetypes.html</a>><br>
> <br>
> Maybe try linking the py file instead?  Sorry I donít have a more definitive answer.  Maybe the others can chime in (eventually).<br>
> Best,<br>
> Elaine<br>
> -----<br>
> Elaine C. Meng, Ph.D.                       <br>
> UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
> Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
> University of California, San Francisco<br>
> <br>
> On Aug 2, 2014, at 12:01 PM, Thomas Hrabe <<a href="mailto:thrabe@sanfordburnham.org">thrabe@sanfordburnham.org</a>> wrote:<br>
> <br>
>> Hi everyone,<br>
>> I have a donwload option on our page for chimera python scripts - one example is attached.<br>
>> When you open it, chimera asks for the filetype. How can I hardocde itís a PDB file?<br>
>> Thanks,<br>
>> Thomas<br>
>> <chimeraMutationFrequency4DKXB.pyc><br>
<br>
</div>
</span></font></div>
</div>

<span><chimeraMutationFrequency2OIDA.py></span>_______________________________________________<br>Chimera-users mailing list<br><a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users<br></blockquote></div><br></div><br><br></body></html>