
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    Dear Chimera User list,<br>

    <br>

    I have a fundamental problem when loading pdb structures and EM

    density maps as *.em. The scale doesn't fit at all, with other words

    my pdb structure<br>

    is tremendously bigger than the EM structure. One work-around is to

    resample the EM structure from current 64 px boxsize with 8.6 A

    pixelsize to 1 A pixelsize, giving<br>

    ~ a 500 pixel volume, but then the volume gets quite big und my

    chimera gets really slow in handling those structures (pdb and big

    EM map at once)...is there any other way to solve this issue like

    scaling the EM structure on the fly in not such a memory consuming

    way...I also wonder if there is any information about the pixelsize

    in the EM header, because then the scaling should be done usually

    automatically???<br>

    <br>

    Thanks in advance,<br>

    <br>

    Chris<br>

    <br>

    P.S. I couldn't find anything related to this in the chimera

    archive...<br>

    <div class="moz-signature">-- <br>

      <b>Christian Geiss, M.sc.</b><br>

      Universitaet Frankfurt BMLS<br>

      Frangakis Group<br>

      Max-von-Laue-Strasse 15<br>

      D - 60438 Frankfurt am Main<br>

      Phone: +49-(0)69-79842597<br>

      Fax: +49-(0)69-79846467<br>

      <font color="#0000EE"><a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:geiss@biophysik.org">geiss@biophysik.org</a></font><br>

    </div>

  </body>

</html>