<div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Hello;<br></div>In parameterizing a new metal cluster, I would like to patch the various amino acids (which stand isolated from one another) with what are called by AMBER ACE and NME. I would like to do that within the whole block, not for each amino acid isolated from the block. Also, I would like to avoid tleap, which gets into troubles here.<br>
<br></div>I could do that by modifying structure, but a problem arises of residue names, i.e, the original residue takes the name ACE or NME, or viceversa the capping groups take the name of the amino acid being capped.<br>
<br></div>Is there a specific tool with chimera?<br><br></div>thanks<br><br></div>francesco pietra<br></div>