<div dir="ltr">Good morning,<div><br></div><div>I am currently doing research with a professor for protein-ligand structure and would like to dock the receptor molecule (pdb file of the protein) and ligands (pdb file of the sugars). Since I have both the structure files from Chimera, how would I predict and assume which orientation bound to each other forming a stable complex?</div>
<div><br></div><div>Looking forward to hear from you.</div><div><br></div><div>Thank you so much!</div><div><br></div><div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Sincerely,</span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Sook Y Wong</span></div>
<div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Chemical and Biomolecular Engineering &#39;14</span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">A. James Clark School of Engineering</span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">
<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">University of Maryland, College Park, MD 20742 </span><br style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><a href="mailto:swong18@terpmail.umd.edu" target="_blank" style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">swong18@terpmail.umd.edu</a></div>
</div><div><br></div></div>