<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=iso-8859-1"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Not sure what you mean. &nbsp;If the surface is an isosurface like those displayed by Chimera then the inside has higher density and the outside has lower density. &nbsp;So what does "higher than its neighboring region" mean?<div><br></div><div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>Tom</div><div><br></div><div><br><div><div>On Mar 27, 2014, at 5:40 PM, Anindito Sen wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div><div style="background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: HelveticaNeue, 'Helvetica Neue', Helvetica, Arial, 'Lucida Grande', sans-serif; font-size: 14pt; "><div style="RIGHT: auto"><span style="RIGHT: auto">Dear all,</span></div>
<div style="RIGHT: auto"><span style="RIGHT: auto"></span>&nbsp;</div>
<div style="RIGHT: auto"><span style="RIGHT: auto">I was wondering if &nbsp;there is any way&nbsp;one can measure the surface area with a threshold higher than its neighbouring region&nbsp;in a TEM micrograph ?</span></div>
<div style="RIGHT: auto"><span style="RIGHT: auto"></span>&nbsp;</div>
<div style="RIGHT: auto"><span style="RIGHT: auto">Thanks</span></div>
<div style="RIGHT: auto"><span style="RIGHT: auto"></span>&nbsp;</div>
<div style="RIGHT: auto"><span style="RIGHT: auto">Andy</span></div>
<div></div>
<div style="RIGHT: auto">&nbsp;</div>
<div style="RIGHT: auto"><font class="Apple-style-span" color="#0000ff" size="7" face="garamond, 'new york', times, serif"><span style="LINE-HEIGHT: 19px; FONT-SIZE: 28px" class="Apple-style-span"><b>
<blockquote style="line-height: normal; font-family: Helvetica; font-size: 16px; font-weight: normal; " type="cite">
<div>
<div>
<div><span style="widows: 2; text-transform: none; text-indent: 0px; border-collapse: separate; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; font-size: 16px; line-height: normal; font-family: Helvetica; white-space: normal; orphans: 2; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; " class="Apple-style-span"><span style="widows: 2; text-transform: none; text-indent: 0px; border-collapse: separate; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; font-size: 16px; line-height: normal; font-family: Helvetica; white-space: normal; orphans: 2; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; " class="Apple-style-span">
<div style="WORD-WRAP: break-word">
<div>
<div><font class="Apple-style-span" color="#341dbb" size="4" face="'Times New Roman'"><b>Dr. Anindito Sen (Ph.D)</b></font></div>
<div><font class="Apple-style-span" color="#341dbb" size="4" face="'Times New Roman'"><b></b></font>&nbsp;</div></div></div></span></span></div></div></div></blockquote>
<div>
<div>
<div>
<div><span style="widows: 2; text-transform: none; text-indent: 0px; border-collapse: separate; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; font-size: 16px; line-height: normal; font-family: Helvetica; white-space: normal; orphans: 2; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; " class="Apple-style-span"><span style="widows: 2; text-transform: none; text-indent: 0px; border-collapse: separate; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; font-size: 16px; line-height: normal; font-family: Helvetica; white-space: normal; orphans: 2; letter-spacing: normal; word-spacing: 0px; " class="Apple-style-span">
<div style="WORD-WRAP: break-word">
<div>
<div><font class="Apple-style-span" color="#341dbb" size="4" face="'Times New Roman'"><b><br></b></font></div></div></div></span></span></div></div></div></div></b></span></font></div></div></div>_______________________________________________<br>Chimera-users mailing list<br><a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users<br></blockquote></div><br></div></body></html>