<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">Perfect, thank you both for the quick responses. Adjusting the default in the source worked perfectly.<div><br></div><div>Cheers,</div><div>Oliver.<br><div><div>On Nov 6, 2013, at 1:36 PM, Eric Pettersen &lt;<a href="mailto:pett@cgl.ucsf.edu">pett@cgl.ucsf.edu</a>&gt; wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=windows-1252"><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><div>On Nov 5, 2013, at 4:45 PM, Oliver Clarke &lt;<a href="mailto:olibclarke@gmail.com">olibclarke@gmail.com</a>&gt; wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">Greetings,<br><br>Is there any way to change the default color for pseudo bonds (e.g. distance monitors)?<br><br>I generally work on a white background, and the default of yellow is very difficult to see. Pretty much everything else in the Chimera GUI seems to be customizable, which I love, but I canít see how to alter the default in this particular instance.</blockquote><br></div><div>Yes, as Elaine said there probably should be an option for this. &nbsp;I will put a feature-request ticket in the Chimera Trac database for this. &nbsp;In the interim, in addition to Elaine's suggestions you could modify your Chimera to do this by editing &lt;your Chimera&gt;/share/StructMeasure/DistMonitor.py, line 61, and change:</div><div><br></div><div>distanceMonitor = addMonitoredGroup('distance monitor')</div><div><br></div><div>to:</div><div><br></div><div>distanceMonitor = addMonitoredGroup('distance monitor', color="purple")</div><div><br></div><div>to make distance monitors default to purple, Obviously you could use any other color name you wanted instead of purple.</div><div><br></div><div>Note that on a Mac "&lt;your Chimera&gt;" is Chimera.app/Contents/Resources.</div><div><br></div><div>--Eric</div><br><div apple-content-edited="true">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; border-spacing: 0px; font-family: Helvetica; font-size: 16px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-indent: 0px; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;"><div style="margin: 0px;"><font face="Helvetica" size="5" style="font: 16.0px Helvetica"><span class="Apple-converted-space">&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></span>Eric Pettersen</font></div><div style="margin: 0px;"><font face="Helvetica" size="5" style="font: 16.0px Helvetica"><span class="Apple-converted-space">&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></span>UCSF Computer Graphics Lab</font></div><div style="margin: 0px;"><font face="Helvetica" size="5" style="font: 16.0px Helvetica"><span class="Apple-converted-space">&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;</span><a href="http://www.cgl.ucsf.edu/">http://www.cgl.ucsf.edu</a></font></div><br class="Apple-interchange-newline"></span>
</div>
<br></div></blockquote></div><br></div></body></html>