<div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Dear Dr. Elaine,<br><br></div><div>Thank you for the reply. <br></div>I tried to report the bug before I mailed this group. To be exact for the past two days, I tried to report the bug. But, It didn't work. <br>

</div>The preference I was talking about is the "web access" in which i changed the http proxy true and tried.<br></div></div>I have tried Fetching pdb, Emdb, which was successful. But, with uniprot I'm getting the previously mentioned error.<br>

</div>I have tried different uniprot Ids but I get the same error.<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Oct 24, 2013 at 10:18 AM, Elaine Meng <span dir="ltr"><<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu" target="_blank">meng@cgl.ucsf.edu</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Pavithra,<br>
I can't reproduce this problem -- the fetch of UniProt oprd_human is successful for me in Chimera 1.7 and newer versions of Chimera.  I don't know what preference you are talking about... if you meant the download directory, that only specifies a local directory for saving the files and should not have "http" in it.<br>


<br>
In general, you should report problems using the Chimera menu: Help... Report a Bug instead of sending email to this address.  In the report form, you can include a description of what you did and your email (if you want feedback).  Some other things to try and maybe mention in the report:  can you fetch anything from UniProt?  Can you fetch anything from any database (PDB, etc.)?<br>


Thanks<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<div><div class="h5"><br>
On Oct 23, 2013, at 6:01 PM, Pavithra wrote:<br>
<br>
> Dear chimera users,<br>
><br>
> I'm trying comparative modeling tutorial in chimera tutorials and I'm getting the following error in using fetch uniprot id.<br>
><br>
> Steps followed:<br>
> Menu--> fetch by ID--> selected uniprot--> "oprd_human" "P41143" (tried all combinations)<br>
><br>
> Error:<br>
><br>
><br>
> BadStatusLine: ''<br>
><br>
>   File "C:\Program Files\Chimera 1.7\bin\lib\httplib.py", line 371, in _read_status<br>
>     raise BadStatusLine(line)<br>
><br>
> See reply log for Python traceback.<br>
><br>
> I tried changing the preference to use "http" but nothing fix it. please help.<br>
><br>
> --<br>
> regards,<br>
> Pavithra.K.B.<br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> Chimera-users mailing list<br>
> <a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>
> <a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" target="_blank">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a><br>
<br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr">regards,<br>Pavithra.K.B. </div>
</div>