<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=iso-8859-1"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hi Pavithra,<div><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>Thanks for reporting the error via the bug-reporting mechanism. &nbsp;Since this problem seems to be affecting no one else, we'll work on it via the bug report rather than via the users list. &nbsp;Expect mail via the bug report soon.</div><div><br></div><div>--Eric</div><div><br><br><div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;Eric Pettersen<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;UCSF Computer Graphics Lab<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;<a href="http://www.cgl.ucsf.edu">http://www.cgl.ucsf.edu</a><br><br></div><br><div><div>On Oct 23, 2013, at 7:12 PM, Pavithra &lt;<a href="mailto:meetpavithramsc@gmail.com">meetpavithramsc@gmail.com</a>&gt; wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div dir="ltr"><div><div><div><div>Dear Dr. Elaine,<br><br></div><div>Thank you for the reply. <br></div>I tried to report the bug before I mailed this group. To be exact for the past two days, I tried to report the bug. But, It didn't work. <br>

</div>The preference I was talking about is the "web access" in which i changed the http proxy true and tried.<br></div>I have tried Fetching pdb, Emdb, which was successful. But, with uniprot I'm getting the previously mentioned error.<br>

</div>I have tried different uniprot Ids but I get the same error.<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Oct 24, 2013 at 10:18 AM, Elaine Meng <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu" target="_blank">meng@cgl.ucsf.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Pavithra,<br>
I can't reproduce this problem -- the fetch of UniProt oprd_human is successful for me in Chimera 1.7 and newer versions of Chimera. &nbsp;I don't know what preference you are talking about... if you meant the download directory, that only specifies a local directory for saving the files and should not have "http" in it.<br>


<br>
In general, you should report problems using the Chimera menu: Help... Report a Bug instead of sending email to this address. &nbsp;In the report form, you can include a description of what you did and your email (if you want feedback). &nbsp;Some other things to try and maybe mention in the report: &nbsp;can you fetch anything from UniProt? &nbsp;Can you fetch anything from any database (PDB, etc.)?<br>


Thanks<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<div><div class="h5"><br>
On Oct 23, 2013, at 6:01 PM, Pavithra wrote:<br>
<br>
&gt; Dear chimera users,<br>
&gt;<br>
&gt; I'm trying comparative modeling tutorial in chimera tutorials and I'm getting the following error in using fetch uniprot id.<br>
&gt;<br>
&gt; Steps followed:<br>
&gt; Menu--&gt; fetch by ID--&gt; selected uniprot--&gt; "oprd_human" "P41143" (tried all combinations)<br>
&gt;<br>
&gt; Error:<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; BadStatusLine: ''<br>
&gt;<br>
&gt; &nbsp; File "C:\Program Files\Chimera 1.7\bin\lib\httplib.py", line 371, in _read_status<br>
&gt; &nbsp; &nbsp; raise BadStatusLine(line)<br>
&gt;<br>
&gt; See reply log for Python traceback.<br>
&gt;<br>
&gt; I tried changing the preference to use "http" but nothing fix it. please help.<br>
&gt;<br>
&gt; --<br>
&gt; regards,<br>
&gt; Pavithra.K.B.<br>
</div></div>&gt; _______________________________________________<br>
&gt; Chimera-users mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>
&gt; <a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" target="_blank">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a><br>
<br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr">regards,<br>Pavithra.K.B.&nbsp;</div>
</div>
_______________________________________________<br>Chimera-users mailing list<br><a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users<br></blockquote></div><br></div><br></body></html>