<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:14pt"><div id="yiv4298566528"><div><div style="color: rgb(0, 0, 0); background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; font-size: 14pt; "><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54"><span id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_81"><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54">Dear All,</div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54"><br></div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54">I need to fit atomic structures of two different proteins of different sizes in a density map. The location of both the proteins in the map is well known. While using the fitting tool, I can get the atomic structure of the bigger protein docked very well, the problem arises while fitting &nbsp;the smaller one. The fit option fails and docks the structure into the region
 of the density map where the atomic structure of the&nbsp;<span style="font-size:14pt;">larger</span><span style="font-size:14pt;" id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_92">&nbsp;protein&nbsp;</span><span style="font-size:14pt;">is
 docked , an incorrect position.&nbsp;</span></div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54"><br></div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54">How can I fit both the atomic structures in the density map correctly? The resolution of the density map is ~10 &nbsp;at FSC cutoff of 0.5</div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54"><br></div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54">Thanks</div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54"><br></div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_54">Andy</div></span></div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_56"></div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_58">&nbsp;</div><div id="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_60"><font class="yiv4298566528Apple-style-span" color="#0000FF" face="garamond, 'new york', times, serif" size="7"><span class="yiv4298566528Apple-style-span" style="font-size:28px;line-height:19px;"><b><blockquote
 type="cite" style="color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-weight: normal; line-height: normal; font-size: 16px; " class="yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_65"><div><div><div><span class="yiv4298566528Apple-style-span yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_66" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; font-size: 16px; "><span class="yiv4298566528Apple-style-span yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_67" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
 font-size: 16px; "><div style="word-wrap:break-word;"><div><div><font class="yiv4298566528Apple-style-span" color="#341dbb" face="'Times New Roman'" size="4"><b>Dr. Anindito Sen (Ph.D)</b></font></div><div><font class="yiv4298566528Apple-style-span" color="#341dbb" face="'Times
 New Roman'" size="4"><b>Department of Cell Biology &amp; Anatomy</b></font></div><div><font class="yiv4298566528Apple-style-span" color="#341dbb" face="'Times New Roman'" size="4"><b>Graduate School of Medicine</b></font></div><div><font class="yiv4298566528Apple-style-span" color="#341dbb" face="'Times New Roman'" size="4"><b>University of Tokyo</b></font></div><div><font class="yiv4298566528Apple-style-span" color="#341dbb" face="'Times New Roman'" size="4"><b>Tel &amp; fax: +81-3-5841-3339</b></font></div></div></div></span></span></div></div></div></blockquote><div><div><div><div><span class="yiv4298566528Apple-style-span yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_74" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px;
 font-size: 16px; "><span class="yiv4298566528Apple-style-span yiv4298566528yui_3_7_2_39_1373612239502_75" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; font-size: 16px; "><div style="word-wrap:break-word;"><div><div><font class="yiv4298566528Apple-style-span" color="#341dbb" face="'Times New Roman'" size="4"><b><br></b></font></div></div></div></span></span></div></div></div></div></b></span></font></div></div></div></div></div></body></html>