<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Hello all,</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif"><br></font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">I have the following problem: when I use molmap to generate&nbsp;</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">a map from an atomic structure, the result is fine: both align.</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">When I use another (Matlab) program to generate the map, the two,</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">when opened in Chimera do not align anymore.</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">My question is how molmap generates an origin index such that</font></div><div><font face="times new
 roman, new york, times, serif">both the map and the structure do align and how Chimera reads (and converts)</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">the xyz origin data from the MRC file?</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif"><br></font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Thank you.</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif"><br></font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">Catalin Buiu</font></div><div><font face="times new roman, new york, times, serif">University of Bucharest, Romania</font></div></div></body></html>