Use match-> align to get a structural superposition and sequence alignment, then set your alignment type to AL2CO. Go to render by attribute and then hit the select by attribute tab. Select the range from 0-whatever your maximum is. Should be around 4 if you've got any conserved tryptophans. That will select all invariant residues. <br><br>Jean-Paul Boissel <boissel@uni-mainz.de> wrote:<br><br><div>Hi, </div><div><br></div><div>By homology modelling, I got putative structures for five closely related amino acid transporters.  Is there any script that will allow the quick selection and visualisation of the invariant residues on the structures?</div><div>Thanks,</div><div><br></div><div>Jean-Paul</div><div><br></div><div> </div>