<div dir="ltr"><div><div><div>Dear Elaine<br><br></div>Thank you very much for your reply.<br></div>It helps me a lot.<br><br></div>Masaki<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Apr 22, 2013 at 4:57 PM, Elaine Meng <span dir="ltr"><<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu" target="_blank">meng@cgl.ucsf.edu</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Masaki,<br>
You can delete all the bonds with command:<br>
<br>
~bond<br>
<br>
<<a href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/midas/bond.html" target="_blank">http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/midas/bond.html</a>><br>
<br>
(use Favorites menu to show Command Line)<br>
<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<div class="im HOEnZb"><br>
On Apr 21, 2013, at 11:02 AM, Masaki Uchida wrote:<br>
<br>
> Dear Chimera users<br>
> Is it possible to hide bonds between spheres (atoms/bonds view)?<br>
> I have a "pdb" file which is a bead model of a protein generated by SAXS analysis.<br>
> When I open the file and changed a view to "sphere" under "atoms/bonds", bonds between beads  are shown.<br>
> I believe the bonds are meaningless in this case and would like to show just spheres (beads).<br>
> Thank you in advance for your help<br>
</div><div class="HOEnZb"><div class="h5">> **********************************************<br>
> Masaki Uchida<br>
> Department of Chemistry&Biochemistry<br>
> Montana State University<br>
> **********************************************<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>**********************************************<br>Masaki Uchida<br>Department of Chemistry&Biochemistry<br>Montana State University<br>**********************************************
</div>