Dear Chimera users!<br><br><br>I have a question about the View Dock plugin. <br>From some servers usually I&#39;ve obtained pdb file of the target protein as well as separate file consisted of all predicted posses which I can visualize in Chimera. <br>
<br>So I wounder to know<br><br>1- How I could hide hydrogen bonds as well as protein&#39;s side chains of the residues which are in contact with the ligands ( on the default both of that two options are turned ON)<br><br>
2- How I could properly save some poses as the separate pdb models ? E.g when I chose to same target.pdb with the #1_pose from the chimera saving menu I obtain protein and ligand with the surrounded residues as two models in one pdb file ( so I must manually merge it in one model and delete residues from the second model). Does it possible to obtain protein-ligand complex as one model as the output?<br>
<br><br>Thanks for help,<br><br>James<br>