<div dir="ltr"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Thank you all for the answers. That is really helpful </span><br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Feb 20, 2013 at 1:29 AM, Francois Berenger <span dir="ltr"><<a href="mailto:berenger@riken.jp" target="_blank">berenger@riken.jp</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="im">On 02/20/2013 02:49 AM, Elaine Meng wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Please see previous answer to same question:<br>
<<a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/pipermail/chimera-users/2013-February/008461.html" target="_blank">http://plato.cgl.ucsf.edu/<u></u>pipermail/chimera-users/2013-<u></u>February/008461.html</a>><br>
</blockquote>
<br></div>
There is the ligplot software also.<br>
Might be nice to have plugged into Chimera.<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="im">
On Feb 18, 2013, at 3:24 AM, kanika sharma wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi All,<br>
<br>
I docked a drug to a protein structure using Autodock Vina. To view the result, I am using View Dock. I now have 5 positions in which the drug is docked into the protein. Is there a way to figure out which residues in the protein are interacting with the drug molecule at each position?<br>

<br>
--<br>
Regards,<br>
<br>
Kanika Sharma<br>
</blockquote>
<br>
<br></div>
______________________________<u></u>_________________<br>
Chimera-users mailing list<br>
<a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>
<a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" target="_blank">http://plato.cgl.ucsf.edu/<u></u>mailman/listinfo/chimera-users</a><br>
<br>
</blockquote>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
Chimera-users mailing list<br>
<a href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu" target="_blank">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a><br>
<a href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users" target="_blank">http://plato.cgl.ucsf.edu/<u></u>mailman/listinfo/chimera-users</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr"><div><b>Regards,</b></div><div><b><br></b></div><div><b><font color="#333333">Kanika Sharma</font></b></div><div><br></div><div><br></div></div>

</div>