<font><font face="verdana,sans-serif">Hi,</font></font><div><font><font face="verdana,sans-serif"><br></font></font></div><div><font><font face="verdana,sans-serif">I am using Patchdock Algorithm to dock two Enzymes.</font></font></div>
<div><font><font face="verdana,sans-serif"><br></font></font></div><div><font><font face="verdana,sans-serif">I get the pdb&#39;s and can load them into Chimera without having problems.</font></font></div><div><font><font face="verdana,sans-serif"><br>
</font></font></div><div><font face="verdana, sans-serif">Because Patchdock only performs a jigsaw puzzle with the two molecules, I have to look at all the solutions it gave me and judge them by some criteria.</font></div>
<div><font face="verdana, sans-serif">This is very time consuming, as I have to match every single solution with the appropriate molecules in chimera and I get tons of solutions.</font></div><div><font face="verdana, sans-serif">I found the following two lists with imo coordinates of the dockings. Is it possible to load these into Chimera or at least to enter the coordinates, so that chimera moves the</font></div>
<div><font face="verdana, sans-serif">docking partner and I can just look at it and discard or accept?</font></div><div><font face="verdana, sans-serif"><br></font></div><div><font face="verdana, sans-serif">These are the example lists</font></div>
<div><font face="verdana, sans-serif"><a href="http://bioinfo3d.cs.tau.ac.il/PatchDock/runs/1_Hexokinase_combined.pdb_2_G6PIsomerase_combined.pdb_37_58_16_6_1_113/trans.txt">http://bioinfo3d.cs.tau.ac.il/PatchDock/runs/1_Hexokinase_combined.pdb_2_G6PIsomerase_combined.pdb_37_58_16_6_1_113/trans.txt</a></font></div>
<div><font face="verdana, sans-serif"><a href="http://bioinfo3d.cs.tau.ac.il/PatchDock/runs/1_Hexokinase_combined.pdb_2_G6PIsomerase_combined.pdb_37_58_16_6_1_113/docking.res">http://bioinfo3d.cs.tau.ac.il/PatchDock/runs/1_Hexokinase_combined.pdb_2_G6PIsomerase_combined.pdb_37_58_16_6_1_113/docking.res</a></font></div>
<div><font face="verdana, sans-serif"><br></font></div><div><font face="verdana, sans-serif">Thanks in advance</font></div><div><font face="verdana, sans-serif">Sebastian</font></div>