Hi Elaine,<br><br>Thank you very much!<br><br>It works! Greatly appreciate it. <br><br>Jianfeng<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Dec 11, 2012 at 5:55 PM, Elaine Meng <span dir="ltr"><<a href="mailto:meng@cgl.ucsf.edu" target="_blank">meng@cgl.ucsf.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Jianfeng,<br>
You can specify width/height of ribbon using Ribbon Style Editor (in menu under Tools... Depiction), the Scaling section.  Optionally, you can save the "scaling" so it will be easy to apply the same dimensions later with the ribscale command. For example, if you had named your scaling "plump":<br>

<br>
ribscale plump<br>
<br>
Ribbon Style Editor:<br>
<<a href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/ribbonstyle/ribbonstyle.html" target="_blank">http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/ContributedSoftware/ribbonstyle/ribbonstyle.html</a>><br>
<br>
"ribscale" command:<br>
<<a href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/midas/ribscale.html" target="_blank">http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/docs/UsersGuide/midas/ribscale.html</a>><br>
<br>
I hope this helps,<br>
Elaine<br>
-----<br>
Elaine C. Meng, Ph.D.<br>
UCSF Computer Graphics Lab (Chimera team) and Babbitt Lab<br>
Department of Pharmaceutical Chemistry<br>
University of California, San Francisco<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Dec 11, 2012, at 2:17 PM, Jianfeng Lin wrote:<br>
<br>
> Hi Chimera Team,<br>
> Is it possible to make the ribbon of PDB crystal structure plumper in Chimera. I wonder it because the ribbon of interested crystal structure looks slim (in flat, edged, or rounded mode), and leaves much empty space when I fit it into my low resolution cryo-ET volume.<br>

> Thank you very much in advance!<br>
> Jianfeng<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div><font color="#999999">Postdoc at Nicastro Lab</font></div>
<div><font color="#999999">Biology Department</font></div>
<div><font color="#999999">Brandeis University</font></div>
<div><font color="#999999">415 South Street, Waltham, MA 02453, USA</font></div>
<div><font color="#999999">Tel. 001-781-736-2439</font></div><br>