
<html dir="ltr">

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>

</head>

<body ocsi="0" fpstyle="1">

<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Dear Chimerians...<br>

<br>

I'm running an analysis about H-bonds geometries in several models.<br>

<br>

I need to measure the distance of a H-bond and the angle formed with a third atom bonded to one of the H-bond atoms.<br>

How could I do that in a python IDLE/script?<br>

<br>

In a more general way, how could I measure the angle between three atoms linked by a bond o pseudobond?<br>

<br>

Thanks in advance<br>

<br>

Yasser<br>

<br>

<span class="moz-txt-tag">-- <br>

</span>Yasser Almeida Hernández, BSc. <br>

Center of Molecular Immunology (CIM) <br>

Tumor Biology Department <br>

216 St.&  15th Ave, Siboney, Playa <br>

P.O.Box 16040, Havana 11600 <br>

CUBA <br>

Phone: (+53-7) 214-3178 <br>

<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:almeida@cim.sld.cu">almeida@cim.sld.cu</a>

<br>

</div>

</body>

</html>