<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <div class="moz-cite-prefix">Hi Alja,<br>
      <br>
      &nbsp; Those little ellipses scattered all over are the end-caps of the
      ribbon helices being drawn in the wrong place.&nbsp; That is a bug.&nbsp;
      You should use Help / Report a Bug to send us a report that will
      include your graphics driver version and operating system.&nbsp; I
      could imagine this bug happening in Chimera daily builds because I
      have changed the ribbon drawing code.&nbsp; But it is surprising to see
      it in the Chimera 1.6 production release.&nbsp; If it is in a daily
      build try the latest daily build.&nbsp; If it is in Chimera 1.6 it is
      most likely a graphics driver bug.&nbsp; You can try to update your
      graphics driver or use a different computer to make this image.<br>
      <br>
      &nbsp;&nbsp;&nbsp; Tom<br>
      <br>
      <br>
    </div>
    <blockquote
      cite="mid:EF3EDF173C61914DA3B99C6D55BF1A1A02F73F@MAIL-KI.ki.si"
      type="cite">
      <pre wrap="">Hi Tom,

you're right. Sorry I haven't thought of that myself.
Here's an image.

Alja

________________________________________
Od: Tom Goddard
Poslano: 17. avgust 2012 2:01
Za: Alja Oblak
Cc: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:chimera-users@cgl.ucsf.edu">chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>
Zadeva: Re: [Chimera-users] a problem with silhouettes

Sending an example image might help debug this.

     Tom

</pre>
      <blockquote type="cite">
        <pre wrap="">Dear Chimera users,

I am trying to create an image for a publication using Chimera 1.6.1.
Whenever I turn on "silhouette" dark spots appear on the screen and on the saved image. They seem totally random but they move along with the structure when rotated. When I zoom on them they look like small "umbrella-shaped" discs. The "show shadows" option is turned off.
Does anybody know what are those spots and how to get rid of them?

Thank you very much for any help.

Regards,
Alja Oblak
_______________________________________________
Chimera-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a>
</pre>
      </blockquote>
      <pre wrap="">&gt;</pre>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Chimera-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Chimera-users@cgl.ucsf.edu">Chimera-users@cgl.ucsf.edu</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users">http://plato.cgl.ucsf.edu/mailman/listinfo/chimera-users</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>