<html>

  <head>

    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"

      http-equiv="Content-Type">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    <div class="moz-cite-prefix">You can choose a map contour so it

      encloses the expected number of cubic Angstroms as described here:<br>

      <br>

<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/data/tutorials/eman07/chimera-eman-2007.html#part2">http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/data/tutorials/eman07/chimera-eman-2007.html#part2</a><br>

      <br>

        Tom<br>

      <br>

    </div>

    <blockquote

cite="mid:CAEYPXnanHdtOMRLep5Ns4-f8tNWnG9roY3Z1r+NQdyK3EA_4oA@mail.gmail.com"

      type="cite">Hello,<br>

      <br>

           My name is Rakesh. I would like to know how to set the

      density threshold according to the molecular mass of the protein

      in the cryoem map. I would also like to know how to calculate the

      molecular mass of a particular segment after segmentation in

      cryoem map.<br>

      <br>

      <pre style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><font>Regards

Rakesh Ramachandran

PhD Student

Molecular Biophysics Unit,

Indian Institute of Science,

Bangalore - 560012

India</font>

</pre>

    </blockquote>

    <br>

  </body>

</html>