
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    Hello,<br>

    I am using chimera to add a shell of water around a given protein

    using the solvate command through the command line. However, upon

    adding solvent, the protein is translated/rotated a bit, as

    mentioned in the documentation (

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html;

      charset=ISO-8859-1">

    <a href="cid:part1.03060408.05020907@pitt.edu">file:///opt/UCSF/Chimera64-1.6/share/chimera/helpdir/ContributedSoftware/solvate/solvate.html</a>).

    However, I would like to leave the protein in it's input coordinates

    and simply add waters around it. <br>

    <br>

    Is there a way to use the solvate command without translation? If

    not, how should I go about resetting the structure back to it's

    original coordinates?<br>

    <br>

    Thanks, <br>

    Matt<br>

    <br>

    Probably unnecessary details:<br>

    Running: USCF Chimera, production version 1.6 (build 35700)<br>

    Under: Ubuntu 12.04 64-bit

  </body>

</html>