<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    Hi Yuhong,<br>
    <br>
      I don't know what kind of map you have.  If it is a
    single-particle electron microscope reconstruction, then the most
    common way to determine resolution is Fourier shell correlation. 
    The original 2-d micrographs are divided into two sets and two 3-d
    maps are computed and then you see how far out in frequency the maps
    agree.  Chimera does not do 3-d reconstructions so this would have
    to be done before analysis in Chimera.  In the Chimera Fit in Map
    dialog it will suggest a default resolution under Options "Use
    simulated map from atoms at resolution...".  The default is 3 times
    the grid plane spacing.  Often the map grid spacing is chosen to be
    about 1/3 the resolution -- a level of oversampling that provides
    nicer visualization.<br>
    <br>
      I don't understand your origin question.  Maybe you mean how do
    you find the center of symmetry of a symmetric map.  The measure
    symmetry command can do that.  For example, "measure symmetry #0" if
    your map is model #0.  Here is documentation.<br>
    <br>
       
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/current/docs/UsersGuide/midas/measure.html#symmetry">http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/current/docs/UsersGuide/midas/measure.html#symmetry</a><br>
    <br>
      Tom<br>
    <br>
    <blockquote
      cite="mid:1335928502.72544.YahooMailNeo@web15801.mail.cnb.yahoo.com"
      type="cite">
      <div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times
        new roman, new york, times, serif;font-size:12pt">
        <div>Hi friends,</div>
        <div>Firstly, I was wondering how to know the resolution of my
          map since one day I opened volume viewer...tools...fit to
          segments. And I found that there displaying "density map
          resolution". So my question is whether that number is the
          correct resolution of my map?</div>
        <div>Secondly, in the volume viewer...corrdinates I can know the
          origin index, but how can I know the origin?</div>
        <div>These questions may seem to be stupid, but I just want to
          know. So h<span style="font-size: 12pt; ">ope to hear from you
            very soon!</span></div>
        <div>Best Wishes,</div>
        <div>Yuhong Lee</div>
      </div>
      <br>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>