<div><span style>Hi there,</span></div><div><font color="#222222" face="arial, sans-serif"><br></font></div><span style>For nogui Chimera:</span><br style><span style>Calls with script in nogui mode create the following traceback.</span><br style>
<br style><span style>terry@daisy[14]% chimera --nogui --script "coord_for_cluster_ATP_</span><span style>bothChiFlip.py"</span><br style><span style>Traceback (most recent call last):</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/__main__.py", line 69, in <module></span><br style>
<span style>   value = chimeraInit.init(sys.argv)</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/chimeraInit.py", line 618, in init</span><br style>
<span style>   chimera.initializeGraphics()</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/chimera/__init__.py"</span><span style>, line 2114, in initializeGraphics</span><br style>
<span style>   bgprefs.initialize()</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/chimera/bgprefs.py", line 211, in initialize</span><br style>
<span style>   onDisplay=_bgPrefDisp, onHide=_bgPrefHide)</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/chimera/preferences/</span><span style>base.py", line 567, in register</span><br style>
<span style>   self._loadCategory(category, cat, inherit, convert)</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/chimera/preferences/</span><span style>base.py", line 482, in _loadCategory</span><br style>
<span style>   cat.load(self._loadDict[name])</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/chimera/preferences/</span><span style>base.py", line 249, in load</span><br style>
<span style>   opt.set(value, asSaved=True, fromPref=True)</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/chimera/preferences/</span><span style>base.py", line 64, in set</span><br style>
<span style>   self._callback(self)</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/chimera/bgprefs.py", line 53, in _backgroundColorCB</span><br style>
<span style>   Midas.background(color=color, setMethod=False)</span><br style><span style> File "/nfs/turing2/labs/sbgrid/</span><span style>programs/i386-linux/chimera/1.</span><span style>6rc/share/Midas/__init__.py", line 966, in background</span><br style>
<span style>   method = chimera.viewer.Solid</span><br style><span style>AttributeError: '_chimera.NoGuiViewer' object has no attribute 'Solid'</span><br clear="all"><div><br></div><div><br></div><div>Best</div>
<div>Longfei</div><div><br></div><div><br></div>-- <br><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;background-color:rgb(255,255,255)"><font color="#333333"><font face="'courier new', monospace"><b>Longfei Wang<br>
</b></font><div style="font-family:'Droid Sans',arial,sans-serif"><span style="white-space:pre-wrap;background-color:rgb(255,255,255)"><font face="'courier new', monospace">Postdoctoral Fellow</font></span><div>
<div><span style="font-size:13px"><font face="'courier new', monospace">Harvard Medical School</font></span></div><div><font face="'courier new', monospace">250 Longwood Ave</font></div></div><div><font face="'courier new', monospace">Boston, MA 02115</font></div>
</div></font></span></div><br>